Referenti UniTrento
prof. Omar Rota-Stabelli (coordinatore)
prof. Gianfranco Anfora
prof. Ilaria Pertot
prof. Nicola Segata
dr. Alberto Maria Cattaneo
Collaborazioni FEM
dr. Claudio Donati, dr. Valerio Mazzoni, dr. Annapaola Rizzoli, dr. Matthias Scholz, dr. Claudio Varotto, dr. Cristiano Vernesi
Il cluster mira a comprendere come gli organismi si siano evoluti e diversificati nel tempo, al fine di spiegarne la biologia, i tratti funzionali e la distribuzione attuale e futura in un contesto di cambiamenti ambientali globali. Ricostruendo le storie evolutive, il gruppo di ricerca fornisce un quadro unificante per interpretare la diversità biologica nei sistemi agricoli, ambientali e biomedici.
I temi di ricerca si concentrano su un'ampia gamma di taxa, tra cui insetti di rilevanza agricola e medico-veterinaria (Drosophila, Aedes, Trissolcus , Halyomorpha , Lobesia , Cydia , Ips , Cacopsylla ), animali di interesse evolutivo e conservazionistico (spugne, crostacei, tardigradi, rettili, mammiferi) e organismi centrali per gli agroecosistemi e la salute ambientale (Wolbachia, coronavirus, fagi, arbovirus, microbiomi umani, animali e del suolo). Il cluster studia anche l'evoluzione di piante e funghi rilevanti per l'agricoltura (Arundo, Fagus, Castanea, Vitis , Ascomycota). Particolare attenzione è rivolta alla comprensione della divergenza evolutiva, dei processi di adattamento e della conservazione delle funzioni geniche nei vari regni viventi.
Dal punto di vista metodologico, il gruppo integra filogenomica, approcci basati sull'orologio molecolare e genomica comparativa, utilizzando un ampio spettro di dati molecolari, che spaziano da marcatori mirati a genomi interi e set di dati derivati dal trascrittoma. In alcuni sistemi, genomi e metagenomi antichi ricostruiti vengono utilizzati per migliorare la calibrazione temporale e l'inferenza evolutiva.
I risultati attesi includono filogenesi solide, cronologie evolutive, risorse genomiche e approfondimenti comparativi che informano la gestione dei parassiti, la conservazione della biodiversità, la genomica funzionale e la ricerca biologica applicata.
Linee di ricerca:
- Risolvere filogenesi complesse utilizzando modelli complessi di evoluzione.
- Orologi molecolari rilassati e calibrazioni fossili.
- Ricostruzione dei genomi a partire da antichi metagenomi e loro utilizzo nella calibrazione degli orologi molecolari.
- Sequenziamento de novo del genoma di artropodi e microbi di importanza agricola e medico-veterinario.
- Genomica comparativa delle famiglie geniche (opsine, chemiorecettori).